নকলা উপজেলার কূল ঘেঁষে দুটি নদী বয়ে গেছে। ব্রহ্মপুত্র নদের শাখা হিসাবে উত্তর পাশ দিয়ে মৃগী নদী বয়ে গেছে আর দক্ষিণ পাশ দিয়ে ইছামতী নদী বয়ে।
এছাড়া ও কুর্শা বিল, বড়বিলা বিল ও বাইরকান্দি বিল উল্লেখযোগ্য।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস